配合環境部推動「一廠一證」政策，落實單一窗口諮詢、統一審查程序及污染流向掌控目標，嘉義市政府環境保護局自109年底起即積極推動環保許可整合作業，針對空氣污染、水污染、廢棄物及毒性化學物質等多項環保許可進行橫向整合，並透過建置標準作業流程與制度化會審機制，展現地方政府落實環境治理的決心與成效。
有鑑於空、水、廢、毒化物污染物流向相關性密切，且該四項污染物之環保許可各自訂有審查管理辦法，易造成事業單位因疏於申請異動而受處分，而多種類之許可亦使環保主管機關及業者無法掌握整廠污染流向，且申請審查資源重複，業者常遇到審查意見競合或補件次數頻繁，各項環保許可申請程序冗長等困擾，故環境部於109年起著手推動環保許可整合工作，以提升審查效率。
嘉義市政府環境保護局推行環保許可整合工作已邁入第5年，累計協助轄內32家事業單位完成許可整合，涵蓋醫療機構、工業廠房與學術單位等多元對象。該局透過「許可整合單一窗口」機制，整合過往分屬於各科室的審查作業，提升內部跨單位溝通效率，避免重複補件與審查意見來回，整體共同會審與業者諮詢作業時程可在14日內完成，大幅精進審查效率。另為強化業者對許可整合作業的瞭解，除了定期辦理許可整合說明會及一對一輔導課程，協助事業單位繪製污染流向圖外，也結合環境部「環境保護許可管理資訊系統（EMS）」要求業者上傳繪製完成之污染流向圖，以利資料整合與後續查核，進而提升環境管理透明度與申請精確度。
嘉義市政府環境保護局表示，藉由整合作業的逐步落實，不僅讓企業於各式環保許可申請更加簡便，也讓空、水、廢、毒污染源管理建立更穩健的法制根基，將持續深化整合作業機制，強化內外部教育訓練與輔導能量，並依環境部最新政策持續精進相關制度推動，朝向高效能、低風險的永續環境目標邁進。